Olá Llui12
Para mim a solução foi reinstalar o Lion.
Eu tenho meu hd particionado. Assim num drive 'Library' eu gravo dados, e no Macintosh HD apenas apps.
Após reinstalar o Lion, voltou a desligar normalmente.
Deste meu post, em setembro, já atualizei para o Mountain Lion e não tive mais o problema.
Creio que tenha sido resolvido pela Apple, mas como eles ignoram alguns problemas, podem ter resolvido numa das atualizações disponíveis e não terem avisado publicamente... Já fizeram isso antes.
Enfim, o problema esta resolvido, mas não sei por que começou... Apenas sei que para resolver, no meu caso foi preciso apagar e instalar novamente o OS X.
Abc.