Anche io ho lo stesso problema, e si ripresenta spesso:
Se provo a uscire da mail rimane accesa la luce sotto l'icona (questo mi uccedeva con OSX 10.7 e anche con l'attuale 10.8.5)
Se provo a riaprire mail mi cambia la bararra in alto come se fosse dentro l'applicazione, ma in realtà non apre nessuna finestra e i comandi nuovo, apri, salva sono disabilitati.
Ho provato a riparare i permessi del disco ma non cambia nulla.
Questo succede spesso, mi sembra soprattutto dopo aver spedito o ricevuto alcune email, cioè dopo aver lavorato con l'applicazione, ma non succede se entro ed esco subito.
Anche se esiste "chiusura forzata" il fatto è che mi piacerebbe non doverlo usare tutte le volte, ma vorrei risolvere il problema...
A qualcuno è capitata la stessa cosa e ha risolto?
Grazie per l'aiuto!