El iPhone no tiene la capacidad de encenderse por su cuenta, así que si lo apagas, por supuesto que ni la alarma ni las otras funcionalidad van a poder avisarte de nada.
Una forma muy sencilla de conseguir lo que quieres de no sufrir "el ataque de las ondas" es poner tu telefono en modo avión al acostarte. De esta forma el iPhone no trata de conseguir señal ni conectarse a la red telefónica ni a internet y, por tanto, no busca ni recibe ondas de ningún tipo. Sin embargo, las funcionalidades que no necesitan conexión a la red, como la alarma, pueden actuar correctamente.
Cuando te suene la alarma, lo segundo que tienes que hacer después de pararla, es quitar el modo avión. Esto es muy facil desde el Centro de Control que sale al arrastrar tu dedo desde debajo de la pantallo hacia arriba.
Espero haberte ayudado.